人的B7H3蛋白3D建模

第二步：generate model result: (勾选include hetroatom)

得到初步的建模序列文件query.B99990001.pdb

第三步：mode optimization (模型进一步动力学优化perform its dynamics!)结果：

这一段也正好是跨膜区，不过感觉显然其跨膜区段包含了太多IgC 的序列

以下是不同的RSPTGAV在模型上的结构位置显示，根据前面的domain分析，这里是个受体结合位点部位可能性较高。

附录

之前的2RCJ序列与4ig比对情况部分截图

>2RCJ

EVQLVQSGGGVVQPGRSLRLSCSSSGFIFSSYAMYWVRQAPGKGLEWVAIIWDDGSDQHYADSVKGRFTISRNDSKNTLFLQMDSLRPEDTGVYFCARDGGSSAPDYWGQGTPVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPQPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEP/EVQLVQSGGGVVQPGRSLRLSCSSSGFIFSSYAMYWVRQAPGKGLEWVAIIWDDGSDQHYADSVKGRFTISRNDSKNTLFLQMDSLRPEDTGVYFCARDGGSSAPDYWGQGTPVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPQPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEP/ESVLTQPPSASGTPGQRVTISCTGTSSGSITVNWYQQLPGMAPKLLIYRDAMRPSGVPTRFSGSKSGTSASLAISGLEAEDESDYYCASWNSSDNSYVFGTGTKVTVLGQPKANPTVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADGSPVKAGVETTKPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPQPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPLSLPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPQVKFNWYVDGVQVHNAKTKPREQQYNSTYRVVSVLTVLHQNWLDGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSL/ESVLTQPPSASGTPGQRVTISCTGTSSGSITVNWYQQLPGMAPKLLIYRDAMRPSGVPTRFSGSKSGTSASLAISGLEAEDESDYYCASWNSSDNSYVFGTGTKVTVLGQPKANPTVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADGSPVKAGVETTKPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPQPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPLSLPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPQVKFNWYVDGVQVHNAKTKPREQQYNSTYRVVSVLTVLHQNWLDGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQV