大数据时代提高生物专业研究生科研创新实践能力教学改革探索

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大数据时代提高生物专业研究生科研创新实践能力教学改革探索

作者：郝爱平 国会艳 薛巨坤 宗宪春 任如意 来源：《安徽农学通报》2017年第17期

摘 要：该文针对地方本科院校研究生生物信息学课程设置存在的一些问题，从教学内容、教学方式和考核方式等几方面提出对于该课程进行改革和建议，为培养具备创新实践能力的研究生人才提供参考。

关键词：生物信息学；研究生；创新实践能力

中图分类号 G642.0 文献标识码 A 文章编号 1007-7731（2017）17-0140-02

Abstract：Aiming at some problems of local college students bioinformatics courses exist，from the aspects of teaching content，teaching methods and assessment methods，suggestions are put forward for providing reference for the curriculum reform，the training of innovative practice ability of students.

Key words：Bioinformatics；Graduate student；Innovative practice ability 生物信息学（bioinformatics）是20世纪80年代未随着人类基因组计划（Human

genomeproject）的启动而兴起的一门新的交叉学科[1]。它涉及生物学、数学、计算机科学和工程学，依赖于计算机科学、工程学和应用数学的基础，依赖于生物实验和衍生数据的大量储存。生物信息学是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，是多学科之间的交叉领域。随着基因组学的不断深入研究和高通量测序数据的大量涌现，生命科学已经进入到大数据时代，基因组、转录组、蛋白质组以及代谢组等生物信息数据正呈爆炸性增长[2-3]。在大数据背景下运用生物信息学技术来分析数据并解决实际问题显得尤为重要，这就需要越来越多的生物信息学人才，尤其是研究生来参与这项工作。本文以提高研究生创新实践能力为角度，结合生物大数据时代的特点，针对目前生物类专业研究生生物信息学教学中存在的问题提出自己的建议和方法，供大家借鉴。

1 《生物信息学》课程中存在的问题

目前，我国大多数高校都在研究生阶段开设了《生物信息学》课程，通过对大多数院校调查发现该门课程开设过程中存在以下问题：（1）生物类研究生本科背景存在一定差异，部分学生在本科高年级阶段就已经学过《生物信息学》这门课程，有些学生没有学过该门课程，但是具有相关分子生物学基础知识；还有一部分跨专业学生没有相关课程基础。（2）教材相对滞后，由于网络时代发展和数据更新速度太快，导致书籍印刷时一些网址和软件介绍就已经落