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实验一 醋酸纤维薄膜电泳分离核苷酸
一. 目的
学习核糖核酸碱水解的原理和方法,掌握核糖核苷酸的醋酸纤维薄膜电泳的原理和方法。
二. 原理
RNA在稀碱条件下水解,先形成中间物2',3'-环状核苷酸,进一步水解得到2'和3'-核苷酸的混合物。
在PH3.5时,各核苷酸的第一磷酸基(PK0.7-1.0)完全解离,第二磷酸基(PK6.0)和稀醇基(PK9.5以上)不解离,而含氮环的解离程度差别很大。(见附表)因此在PH3.5条件下进行电泳可将这四种核苷酸分开。
四种核苷酸在PH3.5时的离子化程度:
核苷酸 AMP GMP CMP UMP 含氮环的PK值 3.70 2.30 4.24 - 离子化程度 0.54 0.05 0.84 净负电荷 0.46 0.95 0.16 1.00 本实验先用稀氢氧化钾溶液将RNA水解,再加高氯酸将水解液调至PH3.5,同时生成高氯酸钾沉淀以除去K+,然后用电泳法分离水解液中各核苷酸,并在紫外分析灯下确定RNA碱水解液的电泳图谱。
三. 仪器、试剂、材料
1. 仪器
电热恒温水浴锅;紫外分析灯(波长为254nm)点样器;离心机;电泳仪和电泳槽 2. 试剂
100ml 0.3mol/L氢氧化钾溶液;40ml 200g/L高氯酸溶液;4g核糖核酸(粉末);1000ml 0.02mol/L PH3.5 柠檬酸缓冲液; 3. 材料
醋酸纤维薄膜(2×8cm)
四. 操作方法
1. RNA的碱水解:
称取0.2g RNA,溶于5ml 0.3mol/L氢氧化钾溶液中,使RNA的浓度达到20-30mg/ml。在37度下保温18小时(或沸水浴30分钟)。然后将水解液转移到锥形瓶内,在水浴中用高氯酸溶液滴定到水解液的PH为3.5。2000转/分离心10分钟,除去沉淀,上清液即为样品液。 2. 点样
将醋酸纤维薄膜在PH3.5 0.02mol/L柠檬酸缓冲液中浸湿后,用滤纸吸去多余的缓冲液。然后将膜条无光泽面向上平铺在玻璃板上,用电样器在距膜条一端2-3cm处点样。 3. 电泳
将点好样的薄膜小心地放入电泳槽内,注意点样的一端应靠近负极。调节电压至160V,电流强度为0.4mA/cm,电泳25分钟。
五. 结果处理
电泳后,将膜条放在滤纸上,紫外分析灯下观察,用铅笔将吸收紫外光的暗斑圈出。
在记录本上绘出RNA水解液的醋酸纤维薄膜电泳图谱,并根据附表中的数据分析确定各斑点代表哪种核苷酸。
六. 注意事项
1. 点样时,在膜条无光泽面点样,且点样量要适中。
2. 电泳时,膜条的点样端要靠近负极。
七. 思考题
1. 为什么点样要点在膜条无光泽的一端?
2. 为什么在PH3.5时进行电泳分离核苷酸的效果最好?醋酸纤维薄膜电泳分离核苦酸
参考文献
刘卫群,陈建新,吴鸣建主编.基础生物化学.北京:气象出版社,2000
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