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过泸器类型

过泸器（filter）是你定义的可以使用的酶切位点的集合。在你自定义过泸器之前，所有酶切位点都会用于序列分析。你可以用和／或来组合过泸器。

MapDraw内臵的过泸器如下：

? Overhang过泸器是根据一套你定义的Overhang准则归类的酶切位

点。这些准则包括3’和5’端突出，与别的酶切位点互补以及兼并的末端突出。克隆试验中，可以使用这个过滤器寻找互补末端。 ? 频率（Frequency）过泸器是指根据出现于指定的范围序列上的频率

归类的酶切位点。我们将在本节的下一部分中使用这个过泸器型。 ? 种类和复杂性过泸器（Class & Complexity）是根据酶切位点种类

归类的酶切位点。这些种类包括：I型（随机）把II型（明确），或者I型+II型。这过泸器也可以根据位点复杂性、价钱和来源进行归类。

? 手动选择过泸器（Manual Pick）允许你按需要选定酶切位点。在随

后的一部分中，我们学习使用手动选择过泸器的方法。

? Must Cut Here/Don’t Cut Here调色板工具也是一种过滤器，随后

进行阐述。

频率过泸器应用

首先让我们用频率过泸器来删除任何可以两次切割我们序列的酶。 ? 从ENZYME MENU，选New Filter，然后Frequency打开参数对话框。

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? 在Min和Max对应的框中输入数字1和2，其他的参数不变。这个设定

将我们序列中切割多于两次的位点自动删除。 ? 在过泸器名字框中，输入“Two-cuts-max.”。

? 单击Apply将过泸器用于序列分析——然后OK退出参数对话框。你将

注意到在图上酶切位点的数目现在大大地减少了。

应用手动过泸器

虽然减少了大约3分之2的位点，但是还有100以上的酶存在。我们还可以设定一些更严紧的命令进行限制。看一看我们的酶是否能整齐地用来切割TETHIS21序列的编码区。

? 从MAP MENU选Linear Minimapp。打开的窗口显示每个限制酶切割位

点的位臵。

? 滚动窗口，直到你看到大的向右的箭头，上写“histone”。“Histone”

是在最初的Genbank入口被注释的序列特点。当我们打开它的时候，这个特点和序列一起输入。 ? 单击选定它。 ? 在屏幕的左

上单击种类调色板工具（Sort），接着选择Sort by Cuts Close to Selection。酶切位点即刻分类，这样，距特点最近而且超出选定范围的酶切位点将会排在最上面。

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? 滚动到窗口的最顶端。你将注意到，在histone基因的左和右有2酶

切位点：Acs I和Apo I。两个酶切位点对我们来说都是理想的。 现在我们将制作仅仅包括Apo I酶切位点的Manual Pick filter。 ? 从ENZYME MENU，选New Filter——然后Manual Pick。打开酶切位

点过泸器编辑器。

? 把Apo I从右边的窗口拖进左边的窗口。给过泸器取名。在这我们把

过泸器叫做“Apo I.”。

? 点击Apply——然后OK，就保存并应用

“Apo I.”过泸器了。

? 注意到现在线性的minimap仅仅由Apo I

酶切位点和histone特点构成。

使用过泸器一览表

现在我们已经应用了2个过泸器：一个叫做“Two-cuts-max”的频率过泸器和叫做“Apo I.”的手动过滤器，MapDraw会自动把两个过泸器的结果用“AND,”联合起来应用，这样，展示的结果需要满足两个标准：切割一或两次，用Apo I切割。我们手动过滤器包括频率过泸器的单一切点的内容，所以他自动的覆盖了频率过泸器的结果。下述过泸器一览表允许我们随意编辑、组合各个过泸器。

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