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硕士研究生分子生物学复习题
1、原核生物基因组与真核生物基因组在结构与组成上的区别。(CH1,28-35) (1)原核生物基因组结构特征:
1.基因组DNA通常为单一闭环双链分子。 2.基因组DNA只有一个复制起点。
3.基因组所含基因数量较多,并且形成操纵子结构。
4.编码序列几乎都是连续的,没有内含子结构,因而转录之后不需要剪接。
5.编码序列约占基因组的50%,比例低于病毒基因组,但高于真核生物基因组。 6.非编码区主要是调控序列。
7.重复基因少,结构基因一般为单拷贝。 8.基因组中含转座子序列。 (2)真核生物基因组结构特点:
1.每一种真核生物都有一定的染色体数目。 2.远大于原核基因组,结构复杂,基因数庞大。 3.真核生物基因转录产物为单顺反子; 4.有大量重复序列,高度重复(106)。 5.真核基因为断裂基因。 6.非编码序列多于编码序列。
7.功能相关基因构成各种基因家族。
8.基因组中含大量转座子、逆转录转座子、逆转录子等可移动序列。 9.真核基因组DNA的末端都有一种称为端粒的特殊结构。 10.真核生物基因组还包括细胞器基因组。
2、试介绍表观遗传学的主要内容
(1)概念:基因的DNA序列不发生改变的情况下,基因的表达水平与功能发生改变,并产生可遗传到的表型。不依赖于DNA序列的遗传现象 (2)特征:可遗传、可逆性、DNA不变 (3)表观遗传学变化主要集中在三个方面: 1.DNA甲基化修饰:基因选择性转录表达的调控 2.非编码RNA的调控作用:基因转录后的调控 3.组蛋白修饰:蛋白质的翻译后修饰 (4)表观遗传学的研究内容:
1.基因选择性转录表达的调控:DNA甲基化、组蛋白共价修饰、染色质重塑、X染色体失活
2.基因转录后的调控:基因组中非编码RNA、微小RNA(miRNA)、反义RNA、内含子、核糖开关等
3、试阐述siRNA与miRNA的异同(CH4,74-75) 共同点:
miRNA和siRNA都是由dsRNA或RNA前体形成的; MiRNA和siRNA都是由22个左右的核苷组成; 都是Dicer酶的产物;
二者生成都需要Argonaute(AGO)家族蛋白存在;
都和RISC结合成复合体行使干扰、调节作用,所以其功能界限变得不清晰(如二者在介导沉默机制上有重叠);
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都可在转录后和翻译水平干扰靶基因的翻译; 不同点: 来源 加工 结构 结合部位 作用方式 功能 siRNA 外源 RNAi的中间产物 dsRNA 靶mRNA任何部位 降解靶mRNA 抑制转座子/病毒入侵 不参与生长发育调控 miRNA 内源基因转录 ss-Pre-miRNA加工 ssRNA 3’UTR 降解或不降解 主要参与生长发育中基因调控 4、什么叫操纵子?简述乳糖操纵子的调节机制。(CH4,28-33)
操纵子是原核生物基因表达和调控最重要的形式,包括结构基因部分和调控部分,原核生物的基因多数以操纵子的形式组成基因表达调控的单元。
乳糖操纵子的调节机制:
1.操纵子的负性调节——阻遏调控 (1)当没有乳糖存在时,Lac操纵子处于阻遏状态。阻遏蛋白与O序列结合,阻遏RNA聚合酶与P序列结合,抑制转录起动。
(2)当乳糖存在时,Lac操纵子即可被诱导。乳糖→半乳糖(诱导剂)与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白构象变化,导致阻遏蛋白与O序列解离,发生转录。
2.操纵子的正性调节——CAP的激活调控
CAP(也称CRP、CGP)是同二聚体,在其分子内有DNA结合区及cAMP结合位点。 当没有葡萄糖存在时cAMP↑,cAMP与CAP结合,CAP结合在lac启动序列附近的CAP位点,可刺激RNA聚合酶活性,表达↑。
当有葡萄糖存在时,cAMP↓、cAMP与CAP结合受阻,lac操纵子表达↓。 3. 乳糖操纵子的双重协调调控
lac阻遏蛋白负性调节与CAP正性调节两种机制协调合作。
当lac阻遏蛋白封闭转录时,CAP不能起作用。但当lac阻遏蛋白脱落时,还需CAP正性调节才能转录。 5、同一生物体不同的组织细胞的基因组成和表达是否相同?为什么?(CH2,45-46+CH4,,4-8)
同一生物体不同的组织细胞的基因组成相同,但表达不完全相同。
基因组指的是单倍体细胞中所含的整套染色体,包括全部遗传信息;基因组是均一的,与细胞类型无关;基因组是稳定不变的,与发育阶段、生长条件无关。
基因表达就是基因的转录和翻译过程。
转录组是指基因组在一种细胞内表达的全部转录产物的总称,可以反映某一生长阶段、某一生理或病理状态下、某一环境条件下,机体细胞所表达基因的种类和表达水平。转录组只反映基因组的一部分;一个基因可以转录得到多种mRNA;基因组在不同条件下有不同的表达模式,转录组是动态的,反映的是正在表达的基因,与细胞类型、发育阶段、生长条件、健康状况等有关。
基因表达的方式分为:组成型表达、适应性/调节性表达和协调表达。
组成型表达指不大受环境变动而变化的一类基因表达。这些基因产物对生命全过程都是必要的或必不可少的,在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达,这类基因称管家基因。
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(如:催化三羧酸循环的酶)
适应性/调节性表达指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达,分为诱导性表达和阻遏性表达。(如:胆固醇对HMGCoA还原酶的表达阻遏)
基因表达具有时间、空间和条件特异性。
6、利用双脱氧末端终止法(Sanger法)测定DNA一级结构的原理与方法。(CH1,67-73) (1)原理:以待测的单链DNA为模板,寡聚核苷酸为引物,在DNA聚合酶的作用下,按碱基互补的原则合成互补DNA单链,在合成过程中链可终止于双脱氧核苷酸处,从而获得不同长度的DNA单链。再经电泳分离、读序而得到待测DNA分子的碱基序列。 (2)反应体系:
模板:单链DNA(待测序的DNA) 酶:大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ 引物:5'端标记的寡核苷酸链
底物:dNTP(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)、ddNTP
四组独立的反应体系,每组均含有dNTP(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)和ddNTP(一种) (3)操作:
1.获得标记片段组
2.电泳:变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 3.显影 4.读序
7、如何以大肠杆菌质粒DNA为载体克隆一个编码动物激素的基因,并使之在大肠杆菌中表达?简要说明实验中可能遇到的问题及可能的解决方法。 方法:
1.目的基因的制备(编码动物激素的基因)
先从组织细胞内提取mRNA,然后以与poly(A)尾互补的寡dT为引物,逆转录合成cDNA,再进行克隆。
2.载体的选择和制备
获取大肠杆菌中的质粒,进行酶切使其线形化,以便与目的基因相连接。所用的酶最好与切割目的基因的酶相同。
3.目的DNA与载体体外连接
采用粘性末端连接质粒和目的基因,质粒和插入片段具有相同的粘性末端。 4.将外源DNA导入宿主细胞
采用CaCl2法、电穿孔法、病毒感染法将重组DNA倒入大肠杆菌中。 5.目的基因的筛选和鉴定
首先筛选出转化菌(平板筛选);然后筛选出带有重组体的克隆(插入灭活法);最后是对DNA重组体进行鉴定(酶切鉴定)。
6.克隆载体的表达
培养筛选出的大肠杆菌,在一定条件下表达目的蛋白。 问题及解决方法:
1.载体自身环化,造成假阳性克隆——使用碱性磷酸酶处理载体,去除DNA或RNA5’端的磷酸根
2.插入片段可双向插入——使用两种限制性内切酶同时切,且是非同尾酶
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8、试介绍G-蛋白偶联受体介导的信号途径及最新研究进展。(CH6,52-71) (一)蛋白激酶A途径(AC-cAMP-PKA途径)
信号分子+G蛋白偶联受体→激活AC→催化ATP生成cAMP→激活PKA→底物蛋白磷酸化→①胞质中磷酸化酶激酶磷酸化→短期效应(糖原合成或分解)
→②细胞核内cAMP元件结合蛋白(CRBP)磷酸化→长期效应(调控基因表达) (二)IP3-DG途径
1.第二信使IP3/DG/Ca2+(IP3-Ca2+途径)
基本过程:信号分子→G蛋白偶联受体→Gq或Go→激活磷脂酶Cβ(PLCβ)→磷脂酰肌醇4,5-二磷酸(PIP2)分解→ DG和IP3→Ca2+↑
2.蛋白激酶C途径(DG-PKC途径) 磷脂酰丝氨酸
配体+受体→GP→PLC→PIP2→DG+IP3 PKC→调节细胞生理活动、基
2+Ca 因表达
肌质网、内质网
9、试介绍酪氨酸激酶受体介导的信号途径及最新研究进展。(CH6,72-81) 常见的下游信号转导途径:
(1)Ras-MAPK级联反应信号转导途径:
信号分子+受体→受体自身酪氨酸残基活化→激活SOS→激活Ras→激活MAPKKK→激活MAPKK→激活MAPK→激活多种效应蛋白,调控细胞分裂、存活和转录因子等
Ras-MAPK途径转导多种生长因子(包括EGF、PDGF、NGF和胰岛素生长因子)、细胞因子、淋巴细胞抗原受体和整合素等信号。
MAPK家族成员的活化需要分子中的酪氨酸和苏氨酸同时磷酸化。
MAPK家族中最重要的有ERK家族、p38 MAPK家族、JNK/SAPK家族。 (2)PI3K/PKB
配体+受体→激活PI3K→催化PIP3产生→激活PKB→使多种蛋白磷酸化→介导代谢调节和细胞存活等效应
10、试介绍一种与基因突变相关的疾病的发病原因。(CH7,37) 单基因遗传性高血压病 1.糖皮质激素可矫正的醛固酮增多症(GRA) 特点:高醛固酮、低肾素
病因:醛固酮合成酶基因突变,与11-?-羟化酶融合,醛固酮分泌不受肾素、血管紧张素调节,只受促肾上腺皮质激素ACTH的调节。表达异常高,血容量无限制增加,导致高血压。ACTH受糖皮质激素抑制。 2.盐皮质激素增多症(AME) 特点:低肾素、低醛固酮
病因:11-?-羟固醇脱氢酶Ⅱ基因突变,活性降低,皮质醇不能转化为皮质酮,皮质醇大量积累,激活非选择性盐皮质激素受体 (皮质酮不能),导致高血压。
11、试介绍一种疾病的分子生物学诊断或治疗的方法和过程。(CH8,36,39,43) 乙型血友病 发病原因:
凝血因子IX缺乏
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治疗方法:
采用基因治疗的方法,通过基因增补的策略, 利用逆转录病毒转移IX因子的cDNA到体外培养的患者皮肤成纤维细胞中,再回植入患者皮下。患者体内可检测IX因子的基因表达产物,浓度约为正常人的5%。
其中基因增补是指针对靶细胞致病基因导入相应正常基因,弥补致病基因缺陷。增补基因导入后与基因组随机整合,致病基因并未除去。 基因治疗的基本程序:
1.目的基因的制备:
逆转录得到IX因子的cDNA 2.靶细胞选择
选择患者皮肤成纤维细胞,体外培养,备用 3.基因导入
利用病毒作载体将IX因子的cDNA高效转移入患者皮肤成纤维细胞内、并能调控其适度表达。
4.细胞筛选鉴定
标记基因技术、基因缺陷型受体细胞技术、基因共转染技术、分子杂交技术、外源基因表达鉴定等方法鉴定倒入成功的细胞。
5.目的基因表达
将转染的成纤维细胞植入患者皮下观察。
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