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原核表达体系的构建 一、实验材料
(1)植物材料:拟南芥
(2)载体及菌株:克隆及测序用载体为pMD18-T,购自Takara公司。宿主菌
DH5α。原核表达载体(pET30c ?)。
(3)PCR引物:登陆GeneBank查找目的基因序列,以目的基因序列为模板设
计引物。
(4)药品试剂:反转录试剂盒(TaKaRa),质粒小提试剂盒(TIANGEN),胶
回收试剂盒,Taq DNA聚合酶(TaKaRa),dNTPs(TaKaRa),限制性内切酶(TaKaRa),T4连接酶(TaKaRa),各种DNA和蛋白marker,各种抗生素类,
二、方法
(1)目的基因的获得(RT-PCR):拟南芥叶片→mRNA→逆转录→cDNA→PCR
→基因(详见王希朝那份);PCR产物用0.8%琼脂糖凝胶分离。 先设计好PCR的引物和PCR的反应程序。 (2)克隆载体的构建:
Ⅰ. 目的基因的切胶回收:
①在紫外灯下迅速用干净的手术刀切下含目的基因的琼脂糖凝胶块,放入已称重的离心管中,在保证目的基因全部回收的同时,应尽量减少胶的体积。
②计算凝胶重量(100 mg相当于100 μl),加入3倍体积solution DE-A,75℃水浴6-8分钟,其间轻柔地颠倒离心管至胶完全融化。
③加入2倍体积solution DE-B,颠倒混匀,将溶液转移到吸附柱中,室温放置1 min,12000 rpm离心1 min。
④取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,加入600 μl Wash solution,室温12000 rpm离心30 s。 ⑤重复步骤④一次。
⑥取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,室温12000 rpm离心1 min。 ⑦将吸附柱放入新的1.5 mL灭菌离心管中,在柱膜中央加入30 μl 75℃预热的ddH2O,室温放置2 min,12000 rpm离心1 min。离心管中的液体即为回收的目的基因片段,可立即使用或保存于-20℃备用。 Ⅱ. 目的片断与克隆载体pMD18-T连接:
pMD 19-T Simple Vector(T载体,小纸盒子中) 1ul
Insert DNA
dH2O Solution I(冰中融化,小纸盒子中,跟T载体一起) 16℃反应30min
2ul 5ul 2ul
5ul(等量)
Ⅲ. E. coli DH5α感受态细胞的制备:
①将E. coli DH5α在LB平板上划线培养过夜。次日,挑取单克隆,接种到5 mL LB培养基中,37℃,200 r/min振荡培养过夜。
②将过夜培养的菌液1 mL加入到100 mL LB培养基中(1: 100),培养2-3 h至OD600=0.5,转入预冷的无菌离心管中,冰上放置10 min,然后于4℃下3000 rpm离心10 min。
③弃去上清,用预冷的0.05 mol/L的无菌CaCl2 溶液10 mL轻轻悬浮细胞,冰上放置20 min,4℃下3000 rpm离心10 min。
④弃去上清,加入4 mL预冷的含15%甘油的0.05 mol/L的CaCl2 溶液,
轻轻悬浮细胞,冰上放置几分钟,即成感受态细胞悬液。
⑤感受态细胞分装成100 μl的小份,于冰上备用,或液氮速冻贮存于-80℃。
Ⅳ. 重组质粒转化E. coli DH5α(热击法)
连接产物加至感受态E.coli DH52(200ul)或(100ul) 【非连接载体
加2ul】 【加入后离火远点轻轻用手拨】
↓
冰上放置20min
↓
42℃水浴热击90s
↓
立即放置冰上2min(勿震荡)
↓
于超净工作台加800ul LB培养液
↓
37℃,150rpm预培养50min
↓
6000rpm离心1min,吸除800ul上清;剩余液体用来悬浮沉淀
↓
涂布LB+Amp平板上,37℃倒置培养12h(于超净工作台吹干液体)。 Ⅴ. 挑取白色单克隆菌落,重悬于5 μl ddH2O中,取其中1 μl用于PCR鉴
定。PCR反应体系和反应程序同上面获取目的基因的PCR一样。 Ⅵ. 重组质粒的提取(TIANGEN质粒小提试剂盒,方法可以看试剂盒说明
书) ①将以上剩余的4 μl菌液接种到5 mL含Amp抗生素的LB液体培养基
中,37℃振荡培养过夜。
②取3 mL菌液,室温12000 rpm离心1 min。 ③弃上清,加入250 μl Solution I,重悬菌体细胞。 ④加入250 μl SolutionⅡ,轻柔颠倒离心管4-6次。
⑤加入350 μl SolutionⅢ,轻柔颠倒离心管6-8次,此时应出现白色絮状沉淀,室温12000 rpm离心10 min。
⑥取上清(注意不要吸到蛋白),转入吸附柱,室温放置1 min,12000 rpm离心1 min。
⑦取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,加入500 μl Wash Solution,室温12000 rpm离心1 min。 ⑧重复步骤⑦一次。
⑨取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,室温12000 rpm离心1 min。 ⑩将吸附柱放入新的1.5 mL灭菌离心管中,在柱膜中央加入60 μl 75℃预热的ddH2O,室温放置2 min,12000 rpm离心1 min。离心管中的液体即为质粒。可立即使用或保存于-20℃备用。 Ⅶ. 重组质粒的酶切鉴定
酶切反应体系、反应温度和反应时间根据内切酶的种类确定设计。酶切产物用0.8%琼脂糖凝胶分离。
Ⅷ. 重组质粒的目的基因的序列测定
重组质粒由测序公司测序。
Ⅸ. 菌种保存
取500μl重组菌液加入等体积50%的无菌甘油(终浓度达到25%),液氮速冻,-80℃保存。
(3)目的基因的原核表达
Ⅰ. 原核表达载体的构建
①克隆载体的构建:必须考虑使用的克隆载体有无多克隆位点,没有就要
特别设计一对上下游引物,分别带上酶切位点,以便插入原核表达载体上相应的多克隆位点。构建克隆载体的方法参见上面步骤。
②重组质粒和表达载体的酶切:酶切反应体系、反应温度和反应时间根据内切酶的种类确定设计。酶切产物用0.8%琼脂糖凝胶分离。 ③回收表达载体酶切片断和目的基因酶切片断:
i. 在紫外灯下迅速用干净的手术刀切下含目的基因的琼脂糖凝胶块,放
入已称重的离心管中,在保证目的基因全部回收的同时,应尽量减少胶的体积。
ii. 计算凝胶重量(100 mg相当于100 μl),加入3倍体积solution DE-A,75℃水浴6-8分钟,其间轻柔地颠倒离心管至胶完全融化。 iii. 加入2倍体积solution DE-B,颠倒混匀,将溶液转移到吸附柱中,室温放置1 min,12000 rpm离心1 min。
iv. 取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,加入600 μl Wash solution,室
温12000 rpm离心30 s。
v. 重复步骤④一次。
vi. 取下吸附柱,倒掉收集管中的废液,室温12000 rpm离心1 min。 vii. 将吸附柱放入新的1.5 mL灭菌离心管中,在柱膜中央加入30 μl
75℃预热的ddH2O,室温放置2 min,12000 rpm离心1 min。离心管中的液体即为回收的目的基因片段,可立即使用或保存于-20℃备用。
④表达载体酶切大片断和目的基因的连接(根据连接酶说明书方法操作)
连接反应体系
反应液成分 体积
10×T4 Buffer 2.5 μl ddH2O 15.5 μl pET30c大片段 2 μl STS(salI/xhoI) 4 μl T4 Ligase 1 μl Total 25 μl
16℃过夜连接。
⑤重组质粒转化E. coli 宿主菌(根据表达载体确定)(热击法)
连接产物加至感受态E.coli DH52(200ul)或(100ul) 【非连接载
体加2ul】 【加入后离火远点轻轻用手拨】
↓
冰上放置20min
↓
42℃水浴热击90s
↓
立即放置冰上2min(勿震荡)
↓
于超净工作台加800ul LB培养液
↓
37℃,150rpm预培养50min
↓
6000rpm离心1min,吸除800ul上清;剩余液体用来悬浮沉淀
↓
涂布LB+Amp平板上,37℃倒置培养12h(于超净工作台吹干液体)。
⑥转化菌的PCR鉴定(菌落PCR)
⑦转化菌的酶切鉴定:转化菌菌液扩大培养,提取质粒,双酶切检测。
酶切反应体系、反应温度和反应时间根据内切酶的种类确定设计。酶切产物用0.8%琼脂糖凝胶分离。 ⑧菌种保存
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