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生化总结

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  • 2025/6/15 16:16:03

蛋白质的结构与功能

100g样品中蛋白质的含量=每克含氮克数*6.26*100

20种编码氨基酸中属于L氨基酸(甘氨酸除外)和a氨基酸(费氨酸除外)均属l-a-氨基酸(共18种)

需要识记的氨基酸符号 非极性疏水性氨基酸:甘氨酸Gly 丙氨酸Ala 缬氨酸Val 亮氨酸Leu 异亮氨酸Ile 苯丙氨酸 Phe 脯氨酸Pro 极性中性氨基酸:色氨酸 Trp(此处老师ppt有错误!) 丝氨酸Ser 酪氨酸Try 半胱氨酸(含球基)Cys 蛋氨酸Met

天冬氨酸Asn 谷氨酸胺 Gln 苏氨酸Thr 酸性氨基酸:天冬酰胺Asp 谷氨酸Glu

碱性氨基酸:赖氨酸Lys 精氨酸Arg 组氨酸His 氨基酸的分类:

根据极性分类:非极性氨基酸,极性中性,极性带正电荷和极性带负电荷 根据R基团的结构分:脂肪族,芳香族,杂环氨基酸和含硫氨基酸 根据酸碱性分:酸性,碱性和中性

根据氨基酸营养成分:必需氨基酸和非必需氨基酸

必需氨基酸:苯(笨)丙氨酸,蛋(蛋)氨酸,赖(来)氨酸,苏(宿)氨酸,色(舍)氨酸,亮(晾)氨酸,(一) ,缬(鞋)氨酸 口诀:笨蛋来宿舍晾一晾鞋

区分半胱氨基酸是编码氨基酸,胱氨酸是非编码氨基酸。

氨基酸的理化性质:无色晶体,熔点高200-300度离子晶体物质,两性解离及等电点(注:其解离程度取决于溶液的酸碱度) 净电荷非静电荷,它仍然带电。

等电点:在某一ph溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势相等,成为兼性离子呈电中性。此时溶液的ph 值即为该溶液的等电点。

Phpi 阴离子 带净负电荷,在电场中向正极移动

在一定的ph 范围内,溶液的ph离pi越远,溶液所携带的正电荷越大。

(原理详解:拿第一种情况来说,ph

肽键:是由一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸氨基脱水而成的化学键,又酰胺键。肽键(—CO—NH—)是蛋白质分子中主要的化学键。。 寡肽少于十个;多肽多于十个(指氨基酸) 肽单元

由于肽键具有部分双键的性质,使构成肽键的四个原子与其相邻的α碳原子被束缚在同一刚性的平面上,这一平面称为肽键平面或肽单元。

肽键的特点:构成双键的碳原子上的孤对电子与羰基有明显的共振作用。

蛋白质的分子结构(大题重点)

分为一级结构和空间结构(234级结构)

一级结构:蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。主要化学键为肽键,有些蛋白质还包括二硫键。一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。 二级结构:蛋白质分子中肽链主链原子在空间的排列方式,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。主要化学键为氢键。

三级结构:整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在空间的排列方式。(结构域属三级结构)主要的化学键:疏水键、离子键、氢键、二硫键和范德华力等。 四级结构:蛋白质分子中各亚基的空间排列方式及亚基之间的相互作用关系。亚基之间的结合力主要是疏水作用,其次是氢键和离子键。也有范德华力、二硫键。

结构域:质量大的蛋白质分子常由两个或数个球状或纤维状的区域组成,每个区域的结构和功能相对独立,称为结构域(domain) 。区域与区域之间以无规卷曲相连。

蛋白质二级结构的主要形式:?a-螺旋 ;β-折叠 ;β-转角 ;无规卷曲。 α-螺旋的结构(要掌握)

多为右手螺旋;每上升一圈需要3.6个氨基酸,上升的高度为0.54nm,即每个氨基酸上升0.15nm;各氨基酸的R侧链伸向螺旋外侧;维持稳定的因素是氢键;每个肽键的亚氨基氢和第四个肽键的羰基氧形成氢键,氢键方向与螺旋中心轴基本平行。 Β-折叠结构的特征(重点)

相邻肽键平面间折叠成110度角,呈锯齿状;几条具有β结构的侧链相互平行,形成β片层,链间形成氢键;侧链基团在肽链平面的上方或下方;平行排列的β结构从n端到c端是顺式,反之为反式。

真题模拟(两处均为为老师上课提的,1处ppt上没有!!!课本上为段落文字,我已替大家总结好,若想深入了解,见课本21页;2题见课件第一章70页) 简答题:简述蛋白质的结构与功能并举例说明。(含一和二两小问) 1.请举例说明一级结构是蛋白质空间构象的基础?

答:用尿素、β-巯基乙醇处理牛核糖核酸酶,破坏其二三级结构,酶活性丧失,肽键却不受影响,一级结构仍存在。用透析方法去除尿素、β-巯基乙醇,二硫键正常配对,该酶恢复至原有水平。所以说一级结构是蛋白质空间构象的基础。 2.请举例说明蛋白质一级结构与功能的关系。

答:由于单个氨基酸的变化引起血红蛋白的亲水性明显下降,从而发生聚集,使红细胞变为镰刀状。 协同效应:一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为协同效应。

变构效应:蛋白质与配体结合后,构象发生改变,从而导致蛋白质的性质和功能发生改变的现象,称为变构效应。(又称别构效应) 蛋白质的理化性质 (一) 蛋白质的两性电离

蛋白质分子除两端的氨基和羧基可解离外,氨基酸残基侧链中某些基团,在一定的溶液pH条件下都可解离成带负电荷或正电荷的基团。(蛋白质的等电点 --要和溶液的等电点有所区分当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子, (二) 蛋白质的胶体性质

蛋白质胶体稳定的因素(很重要!!!):颗粒表面所带同种电荷;水化膜

(三) 蛋白质的变性与复性

在某些物理和化学因素作用下,蛋白质特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。 (变性本质是维持蛋白质空间结构的次级键被破坏,从而导致空间结构被破坏,并不涉及肽键的断裂。所以并不改变蛋白质的一级结构。) (四) 蛋白质的紫外吸收 吸收峰280 nm

选择题考点 (很重要!!)变性的蛋白质易于沉淀,有时蛋白质发生沉淀,但并不变性。

(五) 蛋白质的呈色反应

茚三酮反应,双缩脲反应和3、Folin-酚试剂反应 (六) 蛋白质的沉淀析出

在等电点时析出(并未变性!!)

蛋白质的变性(denaturation):在某些物理和化学因素作用下,蛋白质特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。 蛋白质的复性

若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能,称为复性(renaturation)。

盐析蛋白质不变性且变性蛋白质的分子量不会改变!!! 分离方法原理:

(一) 盐析,有机溶剂和免疫沉淀---常用 (二) 电泳法利用电荷性质将蛋白质分离 (三) 透析和超过滤法纯化

(四) 层析技术利用分配和亲和原理

(五) 超速离心法利用蛋白质颗粒沉降速度不同来分离蛋白质

生化第二章

核酸:是以核苷酸为基本组成的生物大分子。嘌呤和嘧啶中含有共轭双键,对 260nm左右波长的紫外光有较强的吸收。

核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序。 元素组成C、H、O、N、P

核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸) 碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷) DNA是反向平行的右手双螺旋结构。

两股链之间在空间上形成一条大沟和一条小沟。识别DNA碱基序列并与其相互作用的基础。 DNA双链之间形成碱基互补配对。10 个碱基使螺旋上升一圈圈基对层键距0.34nm 氢键是一种稳定双螺旋的力量,横向稳定。碱基堆积力维持纵向稳定。 真核生物染色体由DNA和蛋白质构成,其基本单位是核小体。组蛋白: H1 H2A,H2B H3 H4

RNA的结构:单链 嘌呤不等于嘧啶。局部形成双螺旋。碱基配对不严格,出现GU配对。

存在稀有碱基TRNA.

原核生物mRNA为多顺反子即一条mRNA链可以编码多种蛋白质;真核生物mRNA是单顺反子即一条mRNA只编码一条多肽链。

原核生物直接转录生成mRNA,边转录,边翻译;真核生物,最初转录成hnRNA,经过加工后合成成熟mRNA。

真核生物5’尾端有帽子结构。3’尾端有多聚腺苷的尾巴。要经过剪切,把外弦子连接起来。 tRNA的二级结构三叶草形 三级结构倒L型。 真核生物 5S rRNA 28S rRNA 5.8S rRNA 18S rRNA 原核生物 5S rRNA 23S rRNA 16S rRNA

Tm为解链一般时的温度,其值与G+C所占总碱基数的百分比成正比。

变性吸光度增加,增强反应;复性是指DNA在适当的条件下,两条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象为复性。

细胞内的催化剂以有机生物大分子为主,由细胞自身合成,并与底物特异性结合,称为生物催化剂。

少数酶的活性较低控制着整个代谢途径的反应速率,称为关键酶;反应速率最慢,称为限制酶。

氢原子NAD 被转移基团 氢原子 辅酶或辅基 NAD+ NADP+ FMN FAD 醛基 酰基 烷基 二氧化碳 氨基 硫辛酸 TPP 辅酶A 钴胺素辅酶类 生物素 磷酸吡哆醛 所含维生素 维生素pp 维生素pp 维生素B2 维生素B2 硫辛酸 维生素B1 泛酸 维生素B12 生物素 维生素B6 一氧化碳 四氢叶酸 叶酸

必需基团在空间结构上彼此靠近,组成特定动态构像的局部空间结构,能与底物特异性结合

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蛋白质的结构与功能 100g样品中蛋白质的含量=每克含氮克数*6.26*100 20种编码氨基酸中属于L氨基酸(甘氨酸除外)和a氨基酸(费氨酸除外)均属l-a-氨基酸(共18种) 需要识记的氨基酸符号 非极性疏水性氨基酸:甘氨酸Gly 丙氨酸Ala 缬氨酸Val 亮氨酸Leu 异亮氨酸Ile 苯丙氨酸 Phe 脯氨酸Pro 极性中性氨基酸:色氨酸 Trp(此处老师ppt有错误!) 丝氨酸Ser 酪氨酸Try 半胱氨酸(含球基)Cys 蛋氨酸Met 天冬氨酸Asn 谷氨酸胺 Gln 苏氨酸Thr 酸性氨基酸:天冬酰胺Asp 谷氨酸Glu 碱性氨基酸:赖氨酸Lys 精氨酸Arg 组氨酸His 氨基酸的分类: 根据极性分类:非极性氨基酸,极性中性,极性带正电荷和极性带负电荷 根据R基团

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