当前位置:首页 > 分子生物学(朱玉贤第四版)复习纲要
2、 DNA复制所需的酶和其它蛋白质包括哪些?它们的主要功能是什么?
1.DNA聚合酶:在RNA/DNA的3’-OH末端,以dNTP为底物,按模板DNA上的指令由DNA pol逐个将核苷酸加上去,催化新链不断延长。此外,还具有核酸外切酶活性。
2.DNA拓扑异构酶:通过切断、旋转和再连接作用,理顺DNA链----三级结构的调整 3.解螺旋酶:解开DNA双螺旋
4.单链DNA结合蛋白:维持DNA单链状态
5.引发酶:催化引物RNA分子的合成,为DNA复制提供RNA引物 6.DNA连接酶:使具有相同粘末端或平端的DNA末端连接起来 3、 试述DNA复制的基本过程
DNA复制分为起始、延长、终止三个过程。1.DNA复制的起始:1)DNA复制起点双链解开。DnaA蛋白识别、结合于ori C的重复序列然后在HU的帮助下DnaA蛋白与DNA形成复合物, 促使解链最后在DnaC的协助下,DnaB结合于初步打开的双链,并用其解螺旋酶活性使双链解开一定长度。2)引发前体(preprimosome)的形成。DnaB与oriC组成引发前体3)引发体(primosome)与RNA引物的形成。引发前体进一步与引发酶DnaG组装成引发体,引发体在单链DNA上移动(与其他因子有关),在DnaB的作用下识别DNA复制起点位置。2. DNA链的延伸:1)前导链的延伸.前导链沿着5’→ 3’方向可以连续延长,方向与复制叉方向一致2)滞后链的的延伸.?岗崎片段延伸,引发体在合适的位点合成下一岗崎片段的RNA引物。钳装配器处于准备状态。?岗崎片段延伸到前一个岗崎片段附近时,β亚基脱离DNA polIII,
4β引发体适时解体。?RNA引物与DNA形成的双链被钳装配器识别,被2个β亚基夹住。○
5重复以上步骤。3)DNA复制的终止. 亚基带着DNA/RNA转移到DNA polIII上。○
4、 复制起始过程中各种蛋白质的作用 蛋白 DnaA DnaB DnaC DnaG 功能 协同结合于9bp和13bp重复顺序 短的RNA分子,以帮助解离两条DNA链 结合于DnaG,提供解旋酶活性 和DnaB形成复合体 组蛋白样蛋白,激发复合体形成 引发酶,合成RNA引物 稳定单链 旋转酶,解除正超螺旋 RNA聚合酶 HU SSB TopoⅡ 5、 一个聚合酶Ⅲ全酶/复制体是怎样负责两条链的合成呢?即回环复制模型是如何解释
后随链的合成。
?岗崎片段延伸,引发体在合适的位点合成下一岗崎片段的RNA引物。钳装配器处于准备状态。?岗崎片段延伸到前一个岗崎片段附近时,β亚基脱离DNA polIII,引发体适时解体。
4β亚基带着DNA/RNA?RNA引物与DNA形成的双链被钳装配器识别,被2个β亚基夹住。○
5重复以上步骤。 转移到DNA polIII上。○
6、 原核与真核生物中的DNA聚合酶有哪些?功能如何? 原核生物DNA聚合酶 分类 生物学功能 DNA聚合酶I 切除引物 延长冈崎片段 DNA聚合酶II DNA损伤修复 DNA聚合酶III 延长子链 校读作用 DNA损伤修复 真核生物五种DNA聚合酶 DNA聚合酶 功能 α(Ⅰ) DNA引物合成 δ(Ⅲ) 后随链的合成 ε(Ⅱ) β 校读作用 γ 线粒体DNA复制 前导链的合损伤修复 成,复制修复 7、 端粒的复制模型
(1)首先是端粒酶与端粒DNA结合,端粒酶中的RNA与凸出的3′模板配对; (2)以RNA为模板,在DNA3′端上从头合成DNA; (3)延伸六个nt;
(4)合成一个重复单位后,端粒酶向DNA模板新合成的3′移动, RNA再和模板配对,就这样循环往复,周而复始。最后延伸的3′端再回折,以G·G配对的方式形成发夹结构,产生端粒。
第三节、突变与修复
名词
1、 突变(mutation):可以通过复制而遗传的DNA结构的任何永久性改变 2、 碱基置换(base substitution):一个碱基被另一个碱基替换 3、 转换(transition):嘌呤替代嘌呤、嘧啶替代嘧啶 4、 颠换(transvertion):嘌呤变嘧啶或嘧啶变嘌呤 5、 碱基插入(base insertion): 6、 碱基缺失(base deletion):
7、 同义突变(cosense mutation):指没有改变产物氨基酸序列的密码子变化,与密码子的
简并性相关
8、 错义突变(missense mutation):指碱基序列的改变引起了产物氨基酸序列的改变。 9、 无义突变(Nonsense mutation):指碱基的变化导致了某种氨基酸的密码子变为蛋白质
合成的终止密码子。
10、 移码突变(Frameshift mutation):在正常的DNA分子中,碱基缺失或增加非3的倍数,造成这位置之后的一系列编码发生移位错误的改变,这种现象称移码突变。 11、 正向突变 forward mutation:改变野生型性状的突变
12、 回复突变 reverse mutation:突变体所失去的野生型性状可以通过第二次突变得到恢
复。
13、 抑制突变 Suppressor mutations:真正的原位回复突变很少,而大多数是第二点突变,
原来的突变位点依然存在,而它的表现型效应被基因组第二位点突变所抑制,因而又称为抑制突变 。
14、 基因内抑制突变Intragenic suppressor:在同一基因内发生第二次突变,而抑制或校正
第一次突变所产生的结果
15、 基因间抑制突变Intergenic suppressors:由于在另一基因(抑制基因,suppression gene)
发生突变而产生抑制的现象
16、 错配修复:一种纠正复制后子链中错配碱基的修复方式 17、 直接修复 :是通过一种可连续扫描DNA,识别出损伤部位的蛋白质将损伤部位直接修
复的方法。该修复方法不用切断DNA或切除碱基
18、 切除修复:也称核苷酸外切修复,这是一种取代紫外线等辐射物质所造成的损伤部位
的暗修复系统。包括碱基切除修复和核苷酸切除修复
19、 重组修复:即双链DNA中的一条链发生损伤,在DNA进行复制时,由于该损伤部位
不能成为模板,不能合成互补的DNA链,所以产生缺口,而从原来DNA的对应部位切出相应的部分将缺口填满,从而产生完整无损的子代DNA的这种修复现象 20、 SOS修复 :指DNA受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种DNA修复方式,
修复结果只是能维持基因组的完整性,提高细胞的生成率,但留下的错误较多,故又称为错误倾向修复(error-prone repair),使细胞有较高的突变率
问答
1、引起DNA突变的原因或来源有哪些,突变结果如何?
1.自发突:1)DNA复制中的错误2)DNA的自发性化学变化。碱基的异构互变、碱基的脱氨基作用、脱嘌呤与脱嘧啶、碱基修饰与链断裂、转座成分的致突变作用
2.诱发突变:1)物理因素引起的DNA突变。紫外线的致突变作用、电离辐射引起的DNA损伤、2)化学因素引起的DNA突变。碱基类似物突变剂、直接作用于DNA模板的突变剂、嵌合剂的致突变作用——移码突变剂
结果:1.无影响。改变基因型(genotype)而不改变表现型(phenotype)。产生遗传多态性(DNA多态性,蛋白质多态性)。2.丧失某些功能。生物体结构和功能的异常引起疾病:肿瘤、生殖细胞基因突变传递至后代,导致遗传性疾病的发生。3.致死性4.进化:生物体获得新的性状,适应环境的能力增强。发生了有利于物种生存的结果,使生物进化。 2、阐述DNA的几种修复方式。
重组修复:①受损伤的DNA链复制时,产生的子代DNA在损伤的对应部位出现缺口。②完整的另一条母链DNA与有缺口的子链DNA进行重组交换,将母链DNA上相应的片段填补子链缺口处,而母链DNA出现缺口。③以另一条子链DNA为模板,经DNA聚合酶催化合成一新DNA片段填补母链DNA的缺口,最后由DNA连接酶连接,完成修补。重组修复不能完全去除损伤,损伤的DNA段落仍然保留在亲代DNA链上,只是重组修复后合成的DNA分子是不带有损伤的,但经多次复制后,损伤就被“冲淡”了,在子代细胞中只有一个细胞是带有损伤DNA的
直接修复 :通过种可连续扫描DNA,识别出损伤部位的蛋白质将损伤部位直接修复,该修复方法不用切断DNA或切除碱基
切除修复:在几种酶的协同作用下,先在损伤的任一端打开磷酸二酯键,然后外切掉一段寡核苷酸;留下的缺口由DNA聚合酶催化合成来填补,最后再由连接酶将其连接起来 SOS修复 :是细胞DNA受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种DNA修复方式,当DNA两条链的损伤邻近时,损伤不能被切除修复或重组修复,这时在核苷酸内切酶、外切酶的作用下造成损伤处DNA链空缺,再由损伤诱导产生的一套特殊DNA聚合酶-SOS修复酶类,催化空缺部位·DNA的合成,这时补上去的的核苷酸是随机的,使细胞有较高的突变率。
错配修复:在DNA复制时母链会被甲基化,一旦DNA链上碱基出现错配,修复系统就会根据“保存母链,修复子链”的原则,找出错误碱基所在的DNA链,并在对应于母链甲基化腺苷酸上游鸟苷酸的5′位置切开子链,然后启动修复途径,合成新的子链。
第四节、DNA重组
名词、
1、 重组(recombination): 2 个DNA 分子间或一个DNA 分子的不同部位间,通过断
裂和重接,交换DNA 片段从而改变基因的组合和序列
2、 Holliday model:通过要发生重组的2个DNA分子的2条单链在同一部位断裂,断裂
的游离末端彼此交换形成异源双链,然后2条杂合单链彼此连接形成Holliday连接体。Holliday连接体一旦形成就能进行重排,从而改变链的彼此关系,形成不同的构象,构象决定了在Holliday连接体拆分时是否发生重组
3、 转座子(transposon,Tn):存在于染色体DNA上可自主复制和移位的基本单位 问答
1、 转座重组及其效应
转座重组:转座子从染色体的一个区段转移到另一个区段,即发生转座重组,它既不依靠转座单元和插入区段序列的同源性,也不需要重组酶。 效应:
转座作用除了单纯地移动基因,还打乱了DNA序列而造成缺失、倒位和重排,从基本上改变了染色体的结构。
几十年的研究结果表明转座子存在于所有生物体内,人类基因组中约35%以上的序列为转座子序列,其中大部分与疾病有关
2、 转座子的结构特征、类型及其转座机理
转座子的结构特征:1.端有15-25bp的倒转重复序列,或者叫反向重复序列。而插入位点两侧具有5-9bp的正向重复序列。2.具有编码转座酶的基因,这种酶催化转座子插入新的位置 转座子类型:
原核:(1)简单转座子/插入序列(2) 复合转座子3)类转座因子4)TnA转座子家族。 真核:以DNA-DNA方式转座转座子和反转录转座子
机理:转座酶与靶位点上插入位点的序列结合,像限制性内切酶那样在靶DNA链上形成交叉切割,同时也在转座子的每条链的一端切割。转座子的两条链的自由末端分别和靶DNA的两个插入位点的末端连接在一起成桥,新老两个靶DNA分子就相互连接在一起。 随着转座子和生长的具体条件不同有两种不同的选择:
1.简单转座:在转座子另一末端进行第二次切割,使转座子完全转移到新的DNA中。由DNA聚合酶的作用插进几个核苷酸以完成靶位点复制,并在老的宿主靶DNA上留下一个致死性缺口,或被修复。可见简单转座作用是将转座子转移到新的位点上。
2.复制性转座:转座子DNA没有第二次被切开,而靠DNA聚合酶从第一个切口的末端开始复制,这样产生的结构称为共合体。共合体结构的存在是这种转座过程的有力证据。离解酶催化两个转座子拷贝之间的位点专一性重组,结果每个分子都带有一个转座子拷贝。
第2章、 生物信息传递-转录
名词、
1、 转录的不对称性:在RNA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,
称为转录的不对称性
2、 编码链(coding strand) 或有义链(sense strand):与mRNA序列相同的那条DNA链
3、 模板链 (template strand)或反义链(antisense strand) :根据碱基互补原则指导mRNA合
成的DNA链
4、 转录单元(transcription unit):RNA的转录从DNA模板的特定位点开始,并在一定的位
点终止。此转录区域为一个转录单位。一段可以转录成RNA链的DNA
5、 σ因子:RNA聚合酶全酶的一个亚基,参与启动子的识别,使RNA聚合酶能在正确的
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