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ADT 菜单:Analyze → Dockings → Show as Spheres … 将对接得到的所有分子构象结果都以小球的形式显示。下图(图45)中每一个小球表示该构象的几何中心,以方便不同构象之间的观察比较。
图45:一小球显示不同分子构象的显示效果
ADT菜单:Analyze → Dockings → Show Interactions ADT将自动计算并显示Ligand分子在当前构象下与周围Receptor残基之间的相互作用(图46,47)。
图46:Show Interactions设置对话窗口:Show Hydrogen Bonds as Spheres以及
Binding Site Interactions display options对话窗口
图47:ADT自动显示Ligand和Receptor相互作用的效果,下图为关闭wireframe spheres
contact效果
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