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用BankIt向NCBI在线提交序列

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  • 2025/5/4 14:12:51

3.5 Submission Category

提交范畴,是否直接提交或通过第三方Annotation提交(不是太清楚什么意思,可能指的是从EMBL和DDBJ中导入的数据吧),一般为直接提交,如下图示选择Original,继续CONTINUE;

3.6 Source modifier

选择该病原物的种类,比如质粒、线粒体等;

Source modifier下拉菜单及后面的Value设置:进一步选择该病原物获取信息,比如Country、Host、Clone、Collection date、Strain/Isolate等,至少三项(Organelle/Location为细胞器/位置,该项可以不填写),否则该项不通过,尽量信息全面真实,需要继续添加则点击Add,填写完毕查看下方已填写表格进行信息核对,然后CONTINUE;

3.7 Primers

PCR引物项目,可选项目,不想填写可CONTINUE;

3.8 Features(※)

该步骤重要!将用到之前准备的内容,比如序列内ORFs等信息的填写,并根据之前的选项来填写该步骤,比如需要将DNA翻译为氨基酸序列并进行复制粘贴等,该步操作只需将之前准备信息录入即可,比较耗时;

点击下方“ADD”键,页面将切换为↓

在这里我们需要录入更多与该序列有关的信息,最主要的就是录入之前已经整理好的序列里面的开放阅读框(ORF)信息:Genetic Code设置为”Standard“,5'和3'都勾选上,Protein Name/Protein Description项都填写,将特定区域(ORF)的核苷酸序列翻译为氨基酸序列后(除去末端的终止子)复制到下方的”Amino Acid Sequence“框中,依次录入即可。在这里越详细越好,具体参照实际操作; 3.9 Review and Correct

对已填写信息进行复核及提交,并被告知在2个工作日之内会收到NCBI电邮,需要进一步对序列进行审查核对;

4.至此,基本序列提交已经完工,剩下的事情就是等待审核,大概两个工作日后会收到来自NCBI工作人员的电邮,如有问题会通知你进一步修改信息直到完全无误,包括以后的接受序列号,即你的序列会出现在NCBI里面世界上唯一的一个界面里。

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3.5 Submission Category 提交范畴,是否直接提交或通过第三方Annotation提交(不是太清楚什么意思,可能指的是从EMBL和DDBJ中导入的数据吧),一般为直接提交,如下图示选择Original,继续CONTINUE; 3.6 Source modifier 选择该病原物的种类,比如质粒、线粒体等; Source modifier下拉菜单及后面的Value设置:进一步选择该病原物获取信息,比如Country、Host、Clone、Collection date、Strain/Isolate等,至少三项(Organelle/Location为细胞器/位置,该项可以不填写),否则该项不通过,尽量信息全面真实,需要继续添加则点击Add,填写完毕查看下方已填写表格进行信息核对,然后CONTINU

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