ITRAQ技术需注意的问题与答疑

16．可信程度低于80%的数据有意义吗？

可信程度低于此值的，如果有感兴趣的蛋白可以通过ELISA、WB、Q-PCR、液态芯片等技术手段进一步验证，毕竟LC/MS是研究蛋白组学的方法之一，如全面研究还是要综合各种研究方法。

17．两样本的比值都代表什么？

两样本的比值如果在0.9-1.1之间的，可以认为两样本的含量是一样的，即比值为1：1；而小于0.9或大于1.1均可认为两样本之间的比值是有差异的。

18．质谱图中显示的是各种蛋白吗？

不是各种蛋白而是蛋白被打碎后的离子图谱，由于质谱法是电场和磁场将运动的离子（带电荷的原子、分子或分子碎片）按它们的质荷比分离后进行检测的方法。测出的是离子的准确质量，由此来确定离子的化合物组成。

19．目前开展该项业务的公司有很多，能否推荐下哪家公司做的比较好？

目前能开展itraq的公司挺多的，个人推荐广州辉骏生物做的相对还是不错的。现在据说服务质量挺好，周期大约1个月左右。

20．如果打算开展该项试验，需要提供什么样的样品形式？

最好是提供抽提好的蛋白，冻成干粉，然后用干冰快递过来。组织蛋白抽提不能用含二维电泳的变性剂来裂解蛋白。如果组织的话，存放到-80度冰箱中，然后用干冰快递过来，上海本地的，也可以将组织用冻存管装好，投入液氮中运过来即可。